雷電的電流和電壓極高，如果直接擊中太陽能發電系統，可能會對太陽能電池板、逆變器、充電控制器等關鍵部件造成嚴重的物理損壞。此外，雷電還可能引發火災，對整個設施造成更大的破壞。
即使雷電沒有直接擊中太陽能發電系統，其電磁脈沖也可能對系統的電子設備產生破壞性的影響。例如，它可能破壞逆變器中的電子元件，導致設備失效。
（1）對光伏組件的損害：目前所有種類的太陽能光伏發電電池組件中光電轉換效率高且堅固耐用的是單晶硅電池組件，雷電主要會對硅材料或體內PN結產生傷害，破壞光伏板電池片PN結晶體場，使其產生缺陷，引起雜質遷移，導致單晶硅半導體壽命下降。
（2）對保護器件的損害：雷電會造成浪涌保護器（SPD）、組件旁路二極管功能失效。
針對雷電對光伏電場區造成的巨大影響，一般采用等電位連接、隔離法和加裝保護器等避免雷電危害。
（1）依據GB50065-2011《交流電氣裝置的接地設計規范》，接地阻值應符合系統低要求。光伏方陣接地裝置的沖擊接地電阻不宜大于10Ω，高電阻地區（電阻率大于2000Ω·m）大值應不高于30Ω。
（2）光伏發電站的光伏方陣、光伏發電單元其他設備，以及站區升壓站、綜合樓等建（構）筑物應采取直擊雷防護措施，接閃器不應遮擋光伏組件。
（3）獨立接閃器和泄流引下線應與地光伏發電方陣電氣設備、線路保持足夠的安全距離，應不小于3m。
（4）光伏方陣外圍接閃針（線）宜設置獨立的防雷地網，其他防雷接地宜與站內設施共用地網。
（5）人工垂直接地體的埋設間距宜不小于垂直接地體長度的兩倍，受場地限制時可適當減小。
（6）人工接地體在土壤中的埋設深度不應小于0.5m，并宜敷設在當地凍土層以下。
（7）為防止雷電感應，要將整個光伏發電系統的所有金屬物，包括電池組件外框、設備、機箱/機柜外殼、金屬線管等與聯合接地體等電位連接，并且做到各自獨立接地。光伏發電系統等電位連接。
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